Одно из самых больших богатств монастыря составляла его бесценная библиотека. Она была основана в конце ХV века иноком Досифеем, ставшим впоследствии игуменом Соловецкого монастыря.
Не следует путать его с известным автором описания Соловецкого монастыря архимандритом Досифеем (Немчиновым), жившим в XIX веке. Кстати, существует любопытная версия М.А. Колчина, что автором книги, подписанной архимандритом Досифеем, в действительности являлся ссыльный учитель Ново-Борисовского приходского училища Василий Воскресенский.
Игумен Досифей был образованным и просвещенным человеком, страстным книголюбом. Он — первый соловецкий писатель, написавший Житие Зосимы и Савватия. В отличие от многих писал он «неухищренно», просто, чтобы каждый мог понять написанное. Бывая в Новгороде, Досифей заказывал там переписывать книги для соловецкой библиотеки, причем среди них, как выясняется из сохранившихся списков 1493 и 1494 годов, нет ни одной богослужебной. Досифей стремился создать библиотеку, содержащую книги для чтения и образования.
Досифей первый на Руси ввел книжный знак — экслибрис, указывающий на принадлежность книги определенному лицу или библиотеке. Создание библиотеки Соловков Досифей считал делом своей жизни. Позже, уже в ХVII веке, при монастыре организовали книгописную палату — скрипторий и при нем переплетную мастерскую.
Книги в то время были дороги, писались от руки, украшались цветными миниатюрами. Буквицы разукрашивали золотом и киноварью. Каждая книга представляла произведение и прикладного искусства. Переплет книги делали из деревянных досок, обтянутых кожей. Самые дорогие книги украшали драгоценными камнями, жемчугом и самоцветами. Для лучшей сохранности книги снабжали металлическими застежками. Чтобы пыль не попадала внутрь книг, придумали хранить их корешком вверх. Любили рукописную книгу в Соловках, ценили ее и берегли.